会社の財産を残しておくことはできるでしょうか？

原則として財産を残すことはできません。会社破産の場合、換価・処分できるような価値のあるものは管財人によって処分され、債権者への配当に充てられます。破産申立前に財産を不当に隠匿・損壊することは詐欺破産罪という重い犯罪になるので注意が必要です。